Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RRN3P1Q2M238 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RRN3P1Q2M238 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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