Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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