Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YOR053WYOR053W 342 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RPS7AYOR096W 573 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 UTP13YLR222C 2454 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 PES4YFR023W 1836 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 REG1YDR028C 3045 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 BNI4YNL233W 2679 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RGC1YPR115W 3252 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 STE14YDR410C 720 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RPL23BYER117W 414 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YPS5YGL259W 498 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 SDP1YIL113W 630 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 HSP10YOR020C 321 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YBR032WYBR032W 303 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YIL169CYIL169C 2988 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 PEX1YKL197C 3132 nt3.01□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YAK1YJL141C 2424 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 CRG1YHR209W 876 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YLR287CYLR287C 1068 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 LSM2YBL026W 288 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 CDC33YOL139C 642 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YPL039WYPL039W 951 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 ROG1YGL144C 2058 nt3□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 PHO81YGR233C 3537 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 SLN1YIL147C 3663 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YLR001CYLR001C 2589 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YHL005CYHL005C 393 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 PRE8YML092C 753 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 ORC1YML065W 2745 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 KAP95YLR347C 2586 nt2.99□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 FAR1YJL157C 2493 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 MYO5YMR109W 3660 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 ATP22YDR350C 2055 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YDL242WYDL242W 354 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YJR011CYJR011C 786 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 SMA2YML066C 1110 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YOL134CYOL134C 390 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YPL080CYPL080C 327 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 GPX2YBR244W 489 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 NMA111YNL123W 2994 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 TCB2YNL087W 3537 nt2.98□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 GPI17YDR434W 1605 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 NAB6YML117W 3405 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RAD6YGL058W 519 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RPS23AYGR118W 438 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RNR4YGR180C 1038 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YIL012WYIL012W 342 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 PAU23YLR037C 375 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RPS12YOR369C 432 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 CHS3YBR023C 3498 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 DOA4YDR069C 2781 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 BIT61YJL058C 1632 nt2.97□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 ILS1YBL076C 3219 nt2.96□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.96□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 TSC3YBR058C-A 243 nt2.96□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 AVT2YEL064C 1443 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 RPL29YFR032C-A 180 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 PHD1YKL043W 1101 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YKL066WYKL066W 444 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 SEC22YLR268W 645 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YML003WYML003W 873 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YPP1YGR198W 2454 nt2.95□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 VPS3YDR495C 3036 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 GPI19YDR437W 423 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 RRT13YER066W 558 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YIR040CYIR040C 333 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 HIT1YJR055W 495 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YBL065WYBL065W 345 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 TRZ1YKR079C 2517 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 RNH70YGR276C 1662 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 PFK26YIL107C 2484 nt2.94□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 BFR1YOR198C 1413 nt2.93□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 CWC22YGR278W 1734 nt2.93□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 ENA5YDR038C 3276 nt2.93□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YPL197CYPL197C 414 nt2.93□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 SWD3YBR175W 948 nt2.93□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 FUN30YAL019W 3396 nt2.93□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 ERP6YGL002W 651 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YGL165CYGL165C 579 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YJR079WYJR079W 330 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 TEN1YLR010C 483 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YBL071CYBL071C 309 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YPR197CYPR197C 564 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 KIN82YCR091W 2163 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 RCY1YJL204C 2523 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 SQS1YNL224C 2304 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 MDV1YJL112W 2145 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 SPP382YLR424W 2127 nt2.92□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 TFB1YDR311W 1929 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 BCH1YMR237W 2175 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 ROM1YGR070W 3468 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 SNF12YNR023W 1701 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 TIF35YDR429C 825 nt2.91□□□□□ -1.94
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