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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
ROG1
YGL144C
2058 nt
2.46
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YOR343W-A
YOR343W-A
1317 nt
2.46
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
POL3
YDL102W
3294 nt
2.46
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YKR033C
YKR033C
426 nt
2.46
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YOR283W
YOR283W
693 nt
2.46
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RPL33A
YPL143W
324 nt
2.46
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SWR1
YDR334W
4545 nt
2.46
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SRB8
YCR081W
4284 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ILS1
YBL076C
3219 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ILM1
YJR118C
612 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RPS1A
YLR441C
768 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
LSM2
YBL026W
288 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SSF2
YDR312W
1362 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SDC25
YLL016W
3147 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SMY2
YBR172C
2223 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
TOP2
YNL088W
4287 nt
2.45
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
BAS1
YKR099W
2436 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
TLC1
TLC1
1301 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
BI4
Q0120
1917 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YCR081C-A
YCR081C-A
237 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
CRD1
YDL142C
852 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YDR193W
YDR193W
399 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
TSA2
YDR453C
591 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YGL015C
YGL015C
393 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YIL174W
YIL174W
228 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
APQ13
YJL075C
417 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YJL222W-A
YJL222W-A
228 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YAL042C-A
YAL042C-A
378 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
APC9
YLR102C
798 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YMR316C-A
YMR316C-A
312 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YPR050C
YPR050C
414 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YNL034W
YNL034W
1839 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ESL2
YKR096W
3588 nt
2.44
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
VAC8
YEL013W
1737 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RPL29
YFR032C-A
180 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
MPO1
YGL010W
525 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RAD6
YGL058W
519 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
GIC1
YHR061C
945 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SGM1
YJR134C
2124 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
BER1
YLR412W
825 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
UBX4
YMR067C
1251 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
CRS5
YOR031W
210 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YME2
YMR302C
2553 nt
2.43
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YIL080W
YIL080W
4722 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ORC2
YBR060C
1863 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SPO13
YHR014W
876 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RNP1
YLL046C
750 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
AFB1
YLR040C
675 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ARV1
YLR242C
966 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SMA2
YML066C
1110 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RPL36A
YMR194W
303 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SWM2
YNR004W
441 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ISW1
YBR245C
3390 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RLI1
YDR091C
1827 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
LEU3
YLR451W
2661 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SPR3
YGR059W
1539 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
SAK1
YER129W
3429 nt
2.42
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
ECM5
YMR176W
4236 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
PHO2
YDL106C
1680 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YEF3
YLR249W
3135 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YER038W-A
YER038W-A
381 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
RPL23B
YER117W
414 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
VPH2
YKL119C
648 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
YLR012C
YLR012C
300 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
NAB3
YPL190C
2409 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
PSO2
YMR137C
1986 nt
2.41
□□□□□ -2.02
VAM3
Q12241
MET32
YDR253C
576 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
PRM8
YGL053W
714 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RPS22A
YJL190C
393 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YJL202C
YJL202C
348 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
VPS51
YKR020W
495 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YHC1
YLR298C
696 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YPL080C
YPL080C
327 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
TRM7
YBR061C
933 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YBR197C
YBR197C
654 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RGA2
YDR379W
3030 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
NFT1
YKR103W
3657 nt
2.4
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
AMS1
YGL156W
3252 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
HNT1
YDL125C
477 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YGR050C
YGR050C
357 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
CIC1
YHR052W
1131 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YNL146C-A
YNL146C-A
195 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
PHO80
YOL001W
882 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YPR145C-A
YPR145C-A
237 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
ECM25
YJL201W
1800 nt
2.39
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YDR199W
YDR199W
366 nt
2.38
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
GPI8
YDR331W
1236 nt
2.38
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
LAG1
YHL003C
1236 nt
2.38
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RTT10
YPL183C
3042 nt
2.38
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
TOR1
YJR066W
7413 nt
2.38
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
HRD3
YLR207W
2502 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
SSE1
YPL106C
2082 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YLR001C
YLR001C
2589 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
AXL1
YPR122W
3627 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YCR108C
YCR108C
192 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
HMF1
YER057C
390 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RPL14B
YHL001W
417 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RPL25
YOL127W
429 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
TRS20
YBR254C
528 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YOR296W
YOR296W
3870 nt
2.37
□□□□□ -2.03
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