Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 ROG1YGL144C 2058 nt2.46□□□□□ -2.01
VAM3Q12241 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.46□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 POL3YDL102W 3294 nt2.46□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YKR033CYKR033C 426 nt2.46□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YOR283WYOR283W 693 nt2.46□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RPL33AYPL143W 324 nt2.46□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SWR1YDR334W 4545 nt2.46□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SRB8YCR081W 4284 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ILS1YBL076C 3219 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ILM1YJR118C 612 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RPS1AYLR441C 768 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 LSM2YBL026W 288 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SSF2YDR312W 1362 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SDC25YLL016W 3147 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SMY2YBR172C 2223 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 TOP2YNL088W 4287 nt2.45□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 BAS1YKR099W 2436 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 TLC1TLC1 1301 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 BI4Q0120 1917 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 CRD1YDL142C 852 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YDR193WYDR193W 399 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 TSA2YDR453C 591 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YGL015CYGL015C 393 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YIL174WYIL174W 228 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 APQ13YJL075C 417 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 APC9YLR102C 798 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YPR050CYPR050C 414 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YNL034WYNL034W 1839 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ESL2YKR096W 3588 nt2.44□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 VAC8YEL013W 1737 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RPL29YFR032C-A 180 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 MPO1YGL010W 525 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RAD6YGL058W 519 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 GIC1YHR061C 945 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SGM1YJR134C 2124 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 BER1YLR412W 825 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 UBX4YMR067C 1251 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 CRS5YOR031W 210 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YME2YMR302C 2553 nt2.43□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YIL080WYIL080W 4722 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ORC2YBR060C 1863 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SPO13YHR014W 876 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RNP1YLL046C 750 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 AFB1YLR040C 675 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ARV1YLR242C 966 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SMA2YML066C 1110 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RPL36AYMR194W 303 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SWM2YNR004W 441 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ISW1YBR245C 3390 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RLI1YDR091C 1827 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 LEU3YLR451W 2661 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SPR3YGR059W 1539 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 SAK1YER129W 3429 nt2.42□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 ECM5YMR176W 4236 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 PHO2YDL106C 1680 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YEF3YLR249W 3135 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 RPL23BYER117W 414 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 VPH2YKL119C 648 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 YLR012CYLR012C 300 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 NAB3YPL190C 2409 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 PSO2YMR137C 1986 nt2.41□□□□□ -2.02
VAM3Q12241 MET32YDR253C 576 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 PRM8YGL053W 714 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 RPS22AYJL190C 393 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YJL202CYJL202C 348 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 VPS51YKR020W 495 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YHC1YLR298C 696 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YPL080CYPL080C 327 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 TRM7YBR061C 933 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YBR197CYBR197C 654 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 RGA2YDR379W 3030 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 NFT1YKR103W 3657 nt2.4□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 AMS1YGL156W 3252 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 HNT1YDL125C 477 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YGR050CYGR050C 357 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 CIC1YHR052W 1131 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 PHO80YOL001W 882 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 ECM25YJL201W 1800 nt2.39□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YDR199WYDR199W 366 nt2.38□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 GPI8YDR331W 1236 nt2.38□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 LAG1YHL003C 1236 nt2.38□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 RTT10YPL183C 3042 nt2.38□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 TOR1YJR066W 7413 nt2.38□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 HRD3YLR207W 2502 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 SSE1YPL106C 2082 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YLR001CYLR001C 2589 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 AXL1YPR122W 3627 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YCR108CYCR108C 192 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 HMF1YER057C 390 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 RPL14BYHL001W 417 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 RPL25YOL127W 429 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 TRS20YBR254C 528 nt2.37□□□□□ -2.03
VAM3Q12241 YOR296WYOR296W 3870 nt2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.3 ms