Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BL2E5RIL1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPK3BL2E5RIL1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms