Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE4Q8N205 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms