Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms