Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 YBR209WYBR209W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YDR338CYDR338C 2088 nt3.51□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YCK2YNL154C 1641 nt3.51□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 MDN1YLR106C 14733 nt3.51□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 PEX1YKL197C 3132 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 PKH1YDR490C 2301 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 TOP1YOL006C 2310 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 STT4YLR305C 5703 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YJR030CYJR030C 2238 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 CCM1YGR150C 2595 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 KAP95YLR347C 2586 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YPS5YGL259W 498 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YGR242WYGR242W 309 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YDR061WYDR061W 1620 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 PRP22YER013W 3438 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 NOP4YPL043W 2058 nt3.5□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 ICR1ICR1 3199 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 TMA108YIL137C 2841 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 SMB1YER029C 591 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 LIF1YGL090W 1266 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 MRP8YKL142W 660 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 GOT1YMR292W 417 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YAF9YNL107W 681 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 COQ10YOL008W 624 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 BFR1YOR198C 1413 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 RED1YLR263W 2484 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 FAS1YKL182W 6156 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 MPS1YDL028C 2295 nt3.49□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YGR237CYGR237C 2358 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 RRP5YMR229C 5190 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 PDS5YMR076C 3834 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 SNT1YCR033W 3681 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 SDH7YDR511W 402 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 VEL1YGL258W 621 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 FYV4YHR059W 393 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 ABM1YJR108W 372 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YAR053WYAR053W 297 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 PEP12YOR036W 867 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YPR053CYPR053C 456 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 PWP2YCR057C 2772 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 FRE8YLR047C 2061 nt3.48□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 BMS1YPL217C 3552 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 SEA4YBL104C 3117 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 CHA4YLR098C 1947 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 BCD1YHR040W 1101 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 MRPL31YKL138C 396 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 RPL15AYLR029C 615 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YLR302CYLR302C 363 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 STP2YHR006W 1626 nt3.47□□□□□ -1.85
ATG11Q12527 MSH4YFL003C 2637 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 REC8YPR007C 2043 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 CIN1YOR349W 3045 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 MAK5YBR142W 2322 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 RPL8BYLL045C 771 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YPL142CYPL142C 318 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YEL1YBL060W 2064 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YDL176WYDL176W 2127 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 XRN1YGL173C 4587 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 BYE1YKL005C 1785 nt3.46□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 PHO81YGR233C 3537 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YTA7YGR270W 4140 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 AIM11YER093C-A 414 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YGR035CYGR035C 351 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 RNR4YGR180C 1038 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YLR230WYLR230W 306 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 OST6YML019W 999 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 UBC7YMR022W 498 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 ZEO1YOL109W 342 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 RNH70YGR276C 1662 nt3.45□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YIL054WYIL054W 318 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YJL169WYJL169W 369 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YKL118WYKL118W 312 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YAR070CYAR070C 300 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 ADI1YMR009W 540 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YNL179CYNL179C 438 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.44□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 SRC1YML034W 2505 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 RTT105YER104W 627 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 RPS24BYIL069C 408 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 LSM1YJL124C 519 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YMR141CYMR141C 309 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 PEX11YOL147C 711 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 YOR121CYOR121C 306 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 CHS3YBR023C 3498 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 NTO1YPR031W 2247 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 RPN2YIL075C 2838 nt3.43□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 HFM1YGL251C 3564 nt3.42□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 UTP13YLR222C 2454 nt3.42□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 MUS81YDR386W 1899 nt3.42□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 CBP2YHL038C 1893 nt3.42□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 AUS1YOR011W 4185 nt3.42□□□□□ -1.86
ATG11Q12527 STE14YDR410C 720 nt3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.8 ms