Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 TAD1YGL243W 1203 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 FSH1YHR049W 732 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 FYV4YHR059W 393 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 UTP30YKR060W 825 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 ARF3YOR094W 552 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 STH1YIL126W 4080 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 SIR4YDR227W 4077 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 KAR9YPL269W 1935 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 VPS16YPL045W 2397 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 PRP38YGR075C 729 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 BET3YKR068C 582 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YLR217WYLR217W 324 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 MIX23YBL107C 591 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 IPP1YBR011C 864 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 ORC1YML065W 2745 nt2.41□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RPO41YFL036W 4056 nt2.4□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 MCD1YDL003W 1701 nt2.4□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 SVL3YPL032C 2478 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YCR100CYCR100C 951 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PET191YJR034W 327 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PAU23YLR037C 375 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 IGO1YNL157W 507 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YNL226WYNL226W 411 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 CTF13YMR094W 1437 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YER138CYER138C 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YER160CYER160C 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YJR027WYJR027W 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YML039WYML039W 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YML045WYML045W 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YMR050CYMR050C 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.4□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 DNF1YER166W 4716 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YCR099CYCR099C 468 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YCR108CYCR108C 192 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YDR203WYDR203W 318 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PEX18YHR160C 852 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YJL086CYJL086C 369 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 COX14YML129C 213 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 END3YNL084C 1050 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 BNI1YNL271C 5862 nt2.39□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 ARP8YOR141C 2646 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PDR1YGL013C 3207 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 AFI1YOR129C 2682 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 URK1YNR012W 1506 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PES4YFR023W 1836 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PSO2YMR137C 1986 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 LIN1YHR156C 1023 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 IRC8YJL051W 2469 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 ASG7YJL170C 630 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YKL066WYKL066W 444 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 VPS51YKR020W 495 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 NOP14YDL148C 2433 nt2.38□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 GDI1YER136W 1356 nt2.37□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 UBC13YDR092W 462 nt2.37□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.37□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PAU8YAL068C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 PAU20YOL161C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 OSW7YFR039C 1533 nt2.37□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 ECM25YJL201W 1800 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 CWC23YGL128C 852 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 MRM2YGL136C 963 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 RRF1YHR038W 693 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YET1YKL065C 621 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 RPC25YKL144C 639 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YOR055WYOR055W 435 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YOR283WYOR283W 693 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 CSF1YLR087C 8877 nt2.36□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YGR115CYGR115C 780 nt2.35□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 BRX1YOL077C 876 nt2.35□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 ALG14YBR070C 714 nt2.35□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YBR209WYBR209W 318 nt2.35□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 SCP160YJL080C 3669 nt2.35□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.35□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 TOR1YJR066W 7413 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 COS111YBR203W 2775 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 snR78snR78 87 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 RSM18YER050C 417 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YGL109WYGL109W 324 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YIL082WYIL082W 873 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 RMP1YLR145W 606 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.34□□□□□ -2.03
NFI1Q12216 SME1YOR159C 285 nt2.34□□□□□ -2.03
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