Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 YDR248CYDR248C 582 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 YGR242WYGR242W 309 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 YMR187CYMR187C 1296 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 YOR169CYOR169C 465 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 VID24YBR105C 1089 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 YCL002CYCL002C 792 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 KAR9YPL269W 1935 nt2.56□□□□□ -2
CIK1Q01649 YCR099CYCR099C 468 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 YGR018CYGR018C 330 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 PEF1YGR058W 1008 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 SGM1YJR134C 2124 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 NCS2YNL119W 1482 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 MIX23YBL107C 591 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 ATP3YBR039W 936 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 JID1YPR061C 906 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 ARR2YPR200C 393 nt2.55□□□□□ -2
CIK1Q01649 PRE1YER012W 597 nt2.54□□□□□ -2
CIK1Q01649 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.54□□□□□ -2
CIK1Q01649 YNR021WYNR021W 1215 nt2.54□□□□□ -2
CIK1Q01649 YRR1YOR162C 2433 nt2.54□□□□□ -2
CIK1Q01649 MSB2YGR014W 3921 nt2.54□□□□□ -2
CIK1Q01649 SNF12YNR023W 1701 nt2.54□□□□□ -2
CIK1Q01649 YOR296WYOR296W 3870 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 HSC82YMR186W 2118 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 TLC1TLC1 1301 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 RSM18YER050C 417 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 YIL082WYIL082W 873 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 SDS22YKL193C 1017 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 PAU23YLR037C 375 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 UBC12YLR306W 567 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 PSD2YGR170W 3417 nt2.53□□□□□ -2
CIK1Q01649 YCR108CYCR108C 192 nt2.52□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 PEX18YHR160C 852 nt2.52□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 SMA2YML066C 1110 nt2.52□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 ROY1YMR258C 1662 nt2.52□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 PSK2YOL045W 3306 nt2.52□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 PRP6YBR055C 2700 nt2.52□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 CBF2YGR140W 2871 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 BAS1YKR099W 2436 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YCL020WYCL020W 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YME2YMR302C 2553 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 ACB1YGR037C 264 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 TWF1YGR080W 999 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YMR320WYMR320W 306 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YNL050CYNL050C 813 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YNL235CYNL235C 432 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YOL150CYOL150C 312 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YBR063CYBR063C 1215 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 RGL1YPL066W 1440 nt2.51□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 NAB3YPL190C 2409 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 RPN3YER021W 1572 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 snR59snR59 78 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 GPM2YDL021W 936 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YDR115WYDR115W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 URA5YML106W 681 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 TRM7YBR061C 933 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YPR170CYPR170C 336 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 PSO2YMR137C 1986 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 BCK1YJL095W 4437 nt2.5□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 GDI1YER136W 1356 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YPR089WYPR089W 2667 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 INP53YOR109W 3324 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YDL163WYDL163W 303 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 HMF1YER057C 390 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 TDA2YER071C 381 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 RPL23BYER117W 414 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YLR224WYLR224W 1110 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 RIM9YMR063W 720 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YNL046WYNL046W 519 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YBR197CYBR197C 654 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 TRS130YMR218C 3309 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YKL075CYKL075C 1353 nt2.49□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YPL216WYPL216W 3309 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 SHE4YOR035C 2370 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YRB1YDR002W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YDR250CYDR250C 276 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YJL147CYJL147C 1149 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 PET191YJR034W 327 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 ACF4YJR083C 930 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 JIP3YLR331C 378 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 COX14YML129C 213 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 RPS12YOR369C 432 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 NSL1YPL233W 651 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 DAD3YBR233W-A 285 nt2.48□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YFL012WYFL012W 447 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 FAR7YFR008W 666 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 MND1YGL183C 660 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 SAS2YMR127C 1017 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 YNL179CYNL179C 438 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 RIO2YNL207W 1278 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 VAC8YEL013W 1737 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 PHO2YDL106C 1680 nt2.47□□□□□ -2.01
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