Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 YEL1YBL060W 2064 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YFH1YDL120W 525 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 DAD1YDR016C 285 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 PEA2YER149C 1263 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 COX8YLR395C 237 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YOR152CYOR152C 771 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 SRL4YPL033C 846 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YPR014CYPR014C 330 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YPL150WYPL150W 2706 nt2.69□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RGL1YPL066W 1440 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YDR042CYDR042C 603 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YMR31YFR049W 372 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 PRE4YFR050C 801 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 COG2YGR120C 789 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 AIM18YHR198C 966 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YAP5YIR018W 738 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YJL202CYJL202C 348 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 JIP3YLR331C 378 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YNL046WYNL046W 519 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 GIM3YNL153C 390 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 ARL3YPL051W 597 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 UBX3YDL091C 1368 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 REF2YDR195W 1602 nt2.68□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RPN3YER021W 1572 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YKL075CYKL075C 1353 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 snR76snR76 109 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YDL163WYDL163W 303 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YAL037WYAL037W 804 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 PAU23YLR037C 375 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YPR170CYPR170C 336 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 NPR3YHL023C 3441 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 HOS4YIL112W 3252 nt2.67□□□□□ -1.98
BRF1P29056 RPL14BYHL001W 417 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 AIM19YIL087C 474 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YJL086CYJL086C 369 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 PET191YJR034W 327 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YNL235CYNL235C 432 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 SFM1YOR021C 642 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 snR189snR189 189 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 REV3YPL167C 4515 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 SRO77YBL106C 3033 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 HRD3YLR207W 2502 nt2.66□□□□□ -1.98
BRF1P29056 AXL1YPR122W 3627 nt2.65□□□□□ -1.98
BRF1P29056 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YIL082WYIL082W 873 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 MRP49YKL167C 414 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.65□□□□□ -1.99
BRF1P29056 INP51YIL002C 2841 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 ALY1YKR021W 2748 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 NUP100YKL068W 2880 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 MFB1YDR219C 1398 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RGA2YDR379W 3030 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 FKS3YMR306W 5358 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 FUS1YCL027W 1539 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 SNO3YFL060C 669 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YGR226CYGR226C 210 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YKL123WYKL123W 381 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 ECM9YKR004C 1134 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YMR187CYMR187C 1296 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 SNO2YNL334C 669 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 snR43snR43 209 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YPK1YKL126W 2043 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 MLH1YMR167W 2310 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 NCS2YNL119W 1482 nt2.64□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YDR186CYDR186C 2634 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 SWR1YDR334W 4545 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 BCK1YJL095W 4437 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TIM9YEL020W-A 264 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 FAR7YFR008W 666 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 PRP21YJL203W 843 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RNP1YLL046C 750 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RPL36AYMR194W 303 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YOL029CYOL029C 606 nt2.63□□□□□ -1.99
BRF1P29056 AYT1YLL063C 1425 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 CTF13YMR094W 1437 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 BFR1YOR198C 1413 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 PRE1YER012W 597 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TDA2YER071C 381 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 MST27YGL051W 705 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 SRP21YKL122C 504 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 NYV1YLR093C 762 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 IRC21YMR073C 606 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 NUM1YDR150W 8247 nt2.62□□□□□ -1.99
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