Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00271P0C7V0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms