Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms