Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP13Q86W25 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms