Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms