Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms