Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 TGL2YDR058C 981 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YBR174CYBR174C 315 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YDL163WYDL163W 303 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YHR145CYHR145C 357 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 GPM2YDL021W 936 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 VMA6YLR447C 1038 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YTH1YPR107C 627 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 ECM18YDR125C 1362 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 RAD18YCR066W 1464 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 SKI8YGL213C 1194 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 ARG3YJL088W 1017 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 PBI1YPL272C 1554 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 PBY1YBR094W 2262 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 FBP26YJL155C 1359 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 RPS29BYDL061C 171 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 LSM6YDR378C 261 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YGR039WYGR039W 312 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YKR075CYKR075C 924 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 IGO1YNL157W 507 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 CMR3YPR013C 954 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 TMA7YLR262C-A 195 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 MRPL44YMR225C 297 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 EGD1YPL037C 474 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YDL183CYDL183C 963 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 PGD1YGL025C 1194 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 PET127YOR017W 2403 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 SPC110YDR356W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 TDA10YGR205W 873 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 TRM82YDR165W 1335 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 MON2YNL297C 4911 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YCT1YLL055W 1596 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 FMP27YLR454W 7887 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 RPH1YER169W 2391 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 MCM22YJR135C 720 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 RPS17AYML024W 411 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YMR320WYMR320W 306 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 TYE7YOR344C 876 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 NPL6YMR091C 1308 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 BUD30YDL151C 582 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 SMT3YDR510W 306 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 GRX2YDR513W 432 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 RRT7YLL030C 342 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BRQ12193 YMR045CYMR045C 5268 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 UTP8YGR128C 2142 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 RPC11YDR045C 333 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YKL070WYKL070W 510 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 AI2Q0055 2565 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 TSC13YDL015C 933 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 IRC4YDR540C 540 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 CGR1YGL029W 363 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 COS5YJR161C 1152 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YNL043CYNL043C 321 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 DSS1YMR287C 2910 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 FRK1YPL141C 2598 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 RTT101YJL047C 2529 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 PKP2YGL059W 1476 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 BAS1YKR099W 2436 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 SNF12YNR023W 1701 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 AHC1YOR023C 1701 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 PML1YLR016C 615 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 ARC18YLR370C 537 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 HRT1YOL133W 366 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 RPN8YOR261C 1017 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 PIG2YIL045W 1617 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 UPS2YLR168C 693 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 DIA1YMR316W 1011 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 COX13YGL191W 390 nt1.43□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YNL276CYNL276C 396 nt1.43□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 TIM18YOR297C 579 nt1.43□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 SAR1YPL218W 573 nt1.43□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 MAD3YJL013C 1548 nt1.43□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 SMC4YLR086W 4257 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YKL162CYKL162C 1209 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YOL014WYOL014W 375 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 THI80YOR143C 960 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YPR146CYPR146C 330 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 MSL5YLR116W 1431 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 POM152YMR129W 4014 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 ITT1YML068W 1395 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 MPO1YGL010W 525 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 UTP30YKR060W 825 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YLR124WYLR124W 345 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YCL046WYCL046W 324 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 TFC8YPL007C 1767 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YDR341CYDR341C 1824 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 BUD19YJL188C 309 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 PAU8YAL068C 363 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 PAU20YOL161C 363 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 RNH70YGR276C 1662 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 RUD3YOR216C 1455 nt1.4□□□□□ -2.18
TY1B-BRQ12193 YNL184CYNL184C 327 nt1.4□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YHL044WYHL044W 708 nt1.39□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 SSP2YOR242C 1116 nt1.39□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 NHP2YDL208W 471 nt1.39□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 TPK3YKL166C 1197 nt1.39□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YML084WYML084W 309 nt1.39□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 RPL16BYNL069C 597 nt1.39□□□□□ -2.19
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