Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 ESA1YOR244W 1338 nt2.09□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YPR097WYPR097W 3222 nt2.09□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 BFR1YOR198C 1413 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 ART10YLR392C 1557 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SGT1YOR057W 1188 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 UFE1YOR075W 1041 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 KAR4YCL055W 1008 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 GPI17YDR434W 1605 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 COS111YBR203W 2775 nt2.08□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 KAP123YER110C 3342 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YEL043WYEL043W 2871 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 BRE1YDL074C 2103 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 GUK1YDR454C 564 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SDC1YDR469W 528 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SLD5YDR489W 885 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YEA4YEL004W 1029 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 GLC7YER133W 939 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YGL204CYGL204C 306 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 ACB1YGR037C 264 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 CSI2YOL007C 1026 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YBR090CYBR090C 369 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 UBP16YPL072W 1500 nt2.07□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SKP2YNL311C 2292 nt2.06□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 CBF2YGR140W 2871 nt2.06□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 NPR1YNL183C 2373 nt2.06□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YDR203WYDR203W 318 nt2.06□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 FKS3YMR306W 5358 nt2.06□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 TMN3YER113C 2121 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 ARP5YNL059C 2268 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SLN1YIL147C 3663 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 RPS17AYML024W 411 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 ATX1YNL259C 222 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SME1YOR159C 285 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YIL166CYIL166C 1629 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 RAV1YJR033C 4074 nt2.05□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 USO1YDL058W 5373 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 UBC13YDR092W 462 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 UTP6YDR449C 1323 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 VAB2YEL005C 849 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YKL115CYKL115C 393 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 COA4YLR218C 453 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SLK19YOR195W 2466 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 TYE7YOR344C 876 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YPR089WYPR089W 2667 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.04□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 INO80YGL150C 4470 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YDR338CYDR338C 2088 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SSP1YHR184W 1716 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 CLN3YAL040C 1743 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 SRP1YNL189W 1629 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 PRP6YBR055C 2700 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 RPS24AYER074W 408 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 GPI14YJR013W 1212 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YJR020WYJR020W 333 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YPT52YKR014C 705 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 ECI1YLR284C 843 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 YOR366WYOR366W 354 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 CUP9YPL177C 921 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 DIS3YOL021C 3006 nt2.03□□□□□ -2.08
MSH5Q12175 JIP5YPR169W 1479 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 NEO1YIL048W 3456 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YDL032WYDL032W 312 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 CBS2YDR197W 1170 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 GIC2YDR309C 1152 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 RPL11BYGR085C 525 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 MBB1YJL199C 327 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 IGO1YNL157W 507 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 PEP12YOR036W 867 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 RSA1YPL193W 1146 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YPL276WYPL276W 438 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 RPL11AYPR102C 525 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 VPS16YPL045W 2397 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 PCK1YKR097W 1650 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 GCN2YDR283C 4980 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 AGC1YPR021C 2709 nt2.02□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 FKS1YLR342W 5631 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 ESC2YDR363W 1371 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SNA4YDL123W 423 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 ALB1YJL122W 528 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 DIA1YMR316W 1011 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 GRE2YOL151W 1029 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 TFB6YOR352W 1032 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SEC66YBR171W 621 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 TRZ1YKR079C 2517 nt2.01□□□□□ -2.09
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