Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 ARC18YLR370C 537 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 GRE2YOL151W 1029 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 YCL007CYCL007C 393 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 STN1YDR082W 1485 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 DBF20YPR111W 1695 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 YOL098CYOL098C 3114 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 HOP1YIL072W 1818 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 EAP1YKL204W 1899 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 YDR537CYDR537C 606 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 YLL044WYLL044W 447 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 ADI1YMR009W 540 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 RRP15YPR143W 753 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS68Q12016 ICR1ICR1 3199 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ATP22YDR350C 2055 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SLU7YDR088C 1149 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 CPR5YDR304C 678 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YFR054CYFR054C 579 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YGL039WYGL039W 1047 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YHL044WYHL044W 708 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YNL050CYNL050C 813 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ATP11YNL315C 957 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ARF3YOR094W 552 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 MRPL40YPL173W 894 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 AFT2YPL202C 1251 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ARL1YBR164C 552 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SWD3YBR175W 948 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SNX41YDR425W 1878 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YKL075CYKL075C 1353 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 PEX8YGR077C 1770 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 HFM1YGL251C 3564 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 NSE4YDL105W 1209 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 FIN1YDR130C 876 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 RAV2YDR202C 1056 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SAE2YGL175C 1038 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YGR115CYGR115C 780 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YGR283CYGR283C 1026 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 MRPL38YKL170W 417 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 IRC8YJL051W 2469 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ARK1YNL020C 1917 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 RAD18YCR066W 1464 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 MED1YPR070W 1701 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 VPS38YLR360W 1320 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SRD1YCR018C 666 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 snR83snR83 306 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 HMO1YDR174W 741 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YDR203WYDR203W 318 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 EMI1YDR512C 564 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YFL012WYFL012W 447 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 LOC1YFR001W 615 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 TCD1YHR003C 1290 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 LIN1YHR156C 1023 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 MCR1YKL150W 909 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 CDC123YLR215C 1083 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 INP1YMR204C 1263 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 RPL20AYMR242C 519 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YNL043CYNL043C 321 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 DGR1YNL130C-A 147 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 CSI2YOL007C 1026 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SME1YOR159C 285 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 NTC20YBR188C 423 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 CDC37YDR168W 1521 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 FUS2YMR232W 2034 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 KHA1YJL094C 2622 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SWC4YGR002C 1431 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 BIT61YJL058C 1632 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YDR262WYDR262W 819 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 TIF35YDR429C 825 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 CAP1YKL007W 807 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 DAD2YKR083C 402 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SRL3YKR091W 741 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YPT6YLR262C 648 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 URA5YML106W 681 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SRB4YER022W 2064 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SDC25YLL016W 3147 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 JJJ2YJL162C 1752 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YBT1YLL048C 4986 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YCK2YNL154C 1641 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 PSY2YNL201C 2577 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 SNA4YDL123W 423 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 KEI1YDR367W 666 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 HYP2YEL034W 474 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YER066C-AYER066C-A 501 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 MPP6YNR024W 561 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YBR063CYBR063C 1215 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ATP20YPR020W 348 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 CUR1YPR158W 759 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 RXT2YBR095C 1293 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 MET6YER091C 2304 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 ANR2YKL047W 1551 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 YKL100CYKL100C 1764 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 DSE4YNR067C 3354 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 AVT2YEL064C 1443 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 BRE5YNR051C 1548 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS68Q12016 RAV1YJR033C 4074 nt1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms