Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	ESC2	YDR363W	1371 nt		0.52	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	ITT1	YML068W	1395 nt		0.52	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YCL019W	YCL019W	5313 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	VPS54	YDR027C	2670 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	FSH1	YHR049W	732 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SSF1	YHR066W	1362 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	MRPL6	YHR147C	645 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	UBP11	YKR098C	2154 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	IFH1	YLR223C	3258 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	ATG17	YLR423C	1254 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	VMA6	YLR447C	1038 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SRP1	YNL189W	1629 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SNF5	YBR289W	2718 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	CBF2	YGR140W	2871 nt		0.51	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	MMS22	YLR320W	4365 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	BRE5	YNR051C	1548 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	CTF13	YMR094W	1437 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	PEP8	YJL053W	1140 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	COS5	YJR161C	1152 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	RRG8	YPR116W	834 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YJR039W	YJR039W	3366 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	PRP6	YBR055C	2700 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YCS4	YLR272C	3531 nt		0.5	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	HTA1	YDR225W	399 nt		0.49	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	GPN3	YLR243W	819 nt		0.49	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		0.49	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YMR272W-A	YMR272W-A	114 nt		0.49	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	CAT2	YML042W	2013 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SHE9	YDR393W	1371 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	PAM16	YJL104W	450 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YET1	YKL065C	621 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	HTA2	YBL003C	399 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	NAN1	YPL126W	2691 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SPS2	YDR522C	1509 nt		0.48	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	PMI40	YER003C	1290 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SNO3	YFL060C	669 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	MRPL9	YGR220C	810 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	RPL16A	YIL133C	600 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	TMA22	YJR014W	597 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SNO2	YNL334C	669 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	NDJ1	YOL104C	1059 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	MGE1	YOR232W	687 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	YOR314W	YOR314W	330 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	SEN54	YPL083C	1404 nt		0.47	□□□□□ -2.33
DDR2	P89113	MET18	YIL128W	3099 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YDR170W-A	YDR170W-A	1323 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	IRE1	YHR079C	3348 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	SMT3	YDR510W	306 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	GTR2	YGR163W	1026 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	CLC1	YGR167W	702 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YBR238C	YBR238C	2196 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	TBS1	YBR150C	3285 nt		0.46	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	MGA1	YGR249W	1371 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	AIM14	YGL160W	1713 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	NHP2	YDL208W	471 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	AIM6	YDL237W	1173 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	COS12	YGL263W	1143 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	CMC4	YMR194C-B	222 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	DIA1	YMR316W	1011 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	CNS1	YBR155W	1158 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	KAP120	YPL125W	3099 nt		0.45	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	LEU3	YLR451W	2661 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	HAP4	YKL109W	1665 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	APM3	YBR288C	1452 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	GPM2	YDL021W	936 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YDR521W	YDR521W	336 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YIP1	YGR172C	747 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	MSA2	YKR077W	1092 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	RRT15	YLR162W-A	189 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	OSW5	YMR148W	447 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YNL234W	YNL234W	1281 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	PRM4	YPL156C	855 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	MED8	YBR193C	672 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	UBP3	YER151C	2739 nt		0.44	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	PDS5	YMR076C	3834 nt		0.43	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YNR066C	YNR066C	1311 nt		0.43	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	RPS29B	YDL061C	171 nt		0.43	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YGL177W	YGL177W	348 nt		0.43	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YKL069W	YKL069W	543 nt		0.43	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	EST2	YLR318W	2655 nt		0.43	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	IBA57	YJR122W	1494 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	TGL2	YDR058C	981 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YMR175W-A	YMR175W-A	195 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	URA10	YMR271C	684 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	CMR3	YPR013C	954 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	MGR3	YMR115W	1506 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YPR117W	YPR117W	7470 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	ECM18	YDR125C	1362 nt		0.42	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	SEF1	YBL066C	3447 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	TUS1	YLR425W	3924 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	ADR1	YDR216W	3972 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	PAU3	YCR104W	375 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	CRD1	YDL142C	852 nt		0.41	□□□□□ -2.34

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