Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 RSR1YGR152C 819 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 YGR242WYGR242W 309 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 GIC1YHR061C 945 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 TAP42YMR028W 1101 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 AIM36YMR157C 768 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 SWS2YNL081C 432 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 RPS12YOR369C 432 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 snR191snR191 274 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 BUD4YJR092W 4344 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 ITC1YGL133W 3795 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 AI2Q0055 2565 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 PSY2YNL201C 2577 nt2.85□□□□□ -1.95
SEF1P34228 NDT80YHR124W 1884 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 ALY1YKR021W 2748 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 APC11YDL008W 498 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 BMH2YDR099W 822 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 VPS74YDR372C 1038 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 TCD1YHR003C 1290 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 APQ13YJL075C 417 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 YLR202CYLR202C 327 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 COX14YML129C 213 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 YPR014CYPR014C 330 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 YEL1YBL060W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
SEF1P34228 YOL057WYOL057W 2136 nt2.84□□□□□ -1.96
SEF1P34228 CDC55YGL190C 1581 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 NTO1YPR031W 2247 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 FIN1YDR130C 876 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 RPS26BYER131W 360 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YIL054WYIL054W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 IST3YIR005W 447 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 VID24YBR105C 1089 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 NMA111YNL123W 2994 nt2.83□□□□□ -1.96
SEF1P34228 POL3YDL102W 3294 nt2.82□□□□□ -1.96
SEF1P34228 CHZ1YER030W 462 nt2.82□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YIL029CYIL029C 429 nt2.82□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YKL222CYKL222C 2118 nt2.82□□□□□ -1.96
SEF1P34228 RIM9YMR063W 720 nt2.82□□□□□ -1.96
SEF1P34228 DYN1YKR054C 12279 nt2.82□□□□□ -1.96
SEF1P34228 PPH3YDR075W 927 nt2.81□□□□□ -1.96
SEF1P34228 RPL30YGL030W 318 nt2.81□□□□□ -1.96
SEF1P34228 ILM1YJR118C 612 nt2.81□□□□□ -1.96
SEF1P34228 MRP49YKL167C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
SEF1P34228 PRE8YML092C 753 nt2.81□□□□□ -1.96
SEF1P34228 DBP10YDL031W 2988 nt2.8□□□□□ -1.96
SEF1P34228 PRE1YER012W 597 nt2.8□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YOR331CYOR331C 558 nt2.8□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YOR364WYOR364W 369 nt2.8□□□□□ -1.96
SEF1P34228 TRS20YBR254C 528 nt2.8□□□□□ -1.96
SEF1P34228 FUN30YAL019W 3396 nt2.8□□□□□ -1.96
SEF1P34228 RAX2YLR084C 3663 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 SRC1YML034W 2505 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YOR296WYOR296W 3870 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YDL009CYDL009C 324 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 TIM11YDR322C-A 291 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YIR020CYIR020C 303 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 BET4YJL031C 984 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YAL037WYAL037W 804 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 UBX4YMR067C 1251 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 VPS20YMR077C 666 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YMR144WYMR144W 1029 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 RRG8YPR116W 834 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 CEP3YMR168C 1827 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 TRZ1YKR079C 2517 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 MET10YFR030W 3108 nt2.79□□□□□ -1.96
SEF1P34228 FRE2YKL220C 2136 nt2.78□□□□□ -1.96
SEF1P34228 ARP4YJL081C 1470 nt2.78□□□□□ -1.96
SEF1P34228 BFR1YOR198C 1413 nt2.78□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.78□□□□□ -1.96
SEF1P34228 MTC7YEL033W 420 nt2.78□□□□□ -1.96
SEF1P34228 POM152YMR129W 4014 nt2.78□□□□□ -1.96
SEF1P34228 YME2YMR302C 2553 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YMR31YFR049W 372 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YGL042CYGL042C 306 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YLR252WYLR252W 306 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YNL179CYNL179C 438 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RIO2YNL207W 1278 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 MET6YER091C 2304 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 MES1YGR264C 2256 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RRI2YOL117W 1938 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RSN1YMR266W 2862 nt2.77□□□□□ -1.97
SEF1P34228 BNA4YBL098W 1383 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 NAB6YML117W 3405 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 DAL5YJR152W 1632 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 HMF1YER057C 390 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YLR230WYLR230W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 BER1YLR412W 825 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RSE1YML049C 4086 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 RGC1YPR115W 3252 nt2.76□□□□□ -1.97
SEF1P34228 ICR1ICR1 3199 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 CHO2YGR157W 2610 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 SPR3YGR059W 1539 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 CIC1YHR052W 1131 nt2.75□□□□□ -1.97
SEF1P34228 YLR456WYLR456W 615 nt2.75□□□□□ -1.97
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