Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 DBP10YDL031W 2988 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 DYN1YKR054C 12279 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 ARK1YNL020C 1917 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 SKO1YNL167C 1944 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YKR033CYKR033C 426 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 UBX4YMR067C 1251 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 SWS2YNL081C 432 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 SWD3YBR175W 948 nt2.92□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YRR1YOR162C 2433 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YEL1YBL060W 2064 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 TSC11YER093C 4293 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YCR090CYCR090C 549 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 BMH2YDR099W 822 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YDR220CYDR220C 294 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 VPS74YDR372C 1038 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YDR442WYDR442W 393 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YDR537CYDR537C 606 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 ERP6YGL002W 651 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 PNC1YGL037C 651 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YGL159WYGL159W 1113 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YGR290WYGR290W 444 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 MRPL38YKL170W 417 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 RRT16YNL105W 429 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YNL203CYNL203C 612 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 NGL1YOL042W 1092 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 GAL7YBR018C 1101 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 SEC7YDR170C 6030 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YKL100CYKL100C 1764 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 SLP1YOR154W 1764 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 ECM29YHL030W 5607 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.91□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 SSP1YHR184W 1716 nt2.9□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 YCK2YNL154C 1641 nt2.9□□□□□ -1.94
YBL055CP34220 CHZ1YER030W 462 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 MRM2YGL136C 963 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 RPS22AYJL190C 393 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 TAP42YMR028W 1101 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 ATG3YNR007C 933 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YOR364WYOR364W 369 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 AVT2YEL064C 1443 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 PFF1YBR074W 2931 nt2.9□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 DSE4YNR067C 3354 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 VPS30YPL120W 1674 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 CIC1YHR052W 1131 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 BET4YJL031C 984 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 PBS2YJL128C 2007 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 RPL8BYLL045C 771 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YMR181CYMR181C 465 nt2.89□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 DBF20YPR111W 1695 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 NYV1YLR093C 762 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 JIP3YLR331C 378 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 PUF6YDR496C 1971 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 NDT80YHR124W 1884 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 VHR2YER064C 1518 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 SPR3YGR059W 1539 nt2.88□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 BIT61YJL058C 1632 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YCL019WYCL019W 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 IRC2YDR112W 309 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 EAF6YJR082C 342 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 MCR1YKL150W 909 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YML037CYML037C 1023 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YOR169CYOR169C 465 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 TOM1YDR457W 9807 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YAT2YER024W 2772 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 MET5YJR137C 4329 nt2.87□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 MET32YDR253C 576 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 PRM8YGL053W 714 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YIL174WYIL174W 228 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 DAD2YKR083C 402 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 CDC123YLR215C 1083 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 BER1YLR412W 825 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 ATP19YOL077W-A 207 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 HEM4YOR278W 828 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YOR331CYOR331C 558 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 ALY1YKR021W 2748 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 AXL1YPR122W 3627 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 RAX2YLR084C 3663 nt2.86□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 TFB1YDR311W 1929 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 RRI2YOL117W 1938 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 ICR1ICR1 3199 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YCR108CYCR108C 192 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YGR242WYGR242W 309 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YIL012WYIL012W 342 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YIR020CYIR020C 303 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YLR252WYLR252W 306 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 RIF1YBR275C 5751 nt2.85□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 RPL14BYHL001W 417 nt2.84□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YMR144WYMR144W 1029 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms