Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 GCD10YNL062C 1437 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 NUR1YDL089W 1455 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ARK1YNL020C 1917 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SSN2YDR443C 4263 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 GPN3YLR243W 819 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ATP3YBR039W 936 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 MRPL40YPL173W 894 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YPR014CYPR014C 330 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 PEX34YCL056C 435 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 MAL33YBR297W 1407 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SWR1YDR334W 4545 nt2.32□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 NUP170YBL079W 4509 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 AI2Q0055 2565 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 VHR1YIL056W 1923 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YCR064CYCR064C 411 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 VMA7YGR020C 357 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 FSH1YHR049W 732 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YLR198CYLR198C 360 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 CSI2YOL007C 1026 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 GRE2YOL151W 1029 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 snR191snR191 274 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ESC2YDR363W 1371 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SAK1YER129W 3429 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 TMA64YDR117C 1698 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 JJJ2YJL162C 1752 nt2.31□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 STE11YLR362W 2154 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 NAB6YML117W 3405 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 COX6YHR051W 447 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YAP5YIR018W 738 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 BET3YKR068C 582 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ATG10YLL042C 504 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YLR257WYLR257W 966 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 AIM36YMR157C 768 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YOL106WYOL106W 354 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YBR209WYBR209W 318 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SRP1YNL189W 1629 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 PHO2YDL106C 1680 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SVL3YPL032C 2478 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 DUG2YBR281C 2637 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 NPR3YHL023C 3441 nt2.3□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SCP160YJL080C 3669 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ASI3YNL008C 2031 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 AGE1YDR524C 1449 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 APC11YDL008W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YDL157CYDL157C 357 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 GTR2YGR163W 1026 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 IKI1YHR187W 930 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 GPX1YKL026C 504 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SMD3YLR147C 306 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 END3YNL084C 1050 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 HUA2YOR284W 732 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 RRP15YPR143W 753 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 NGG1YDR176W 2109 nt2.29□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 RTG3YBL103C 1461 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 RPL11BYGR085C 525 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 NOP19YGR251W 591 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 PAU14YIL176C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 PAU1YJL223C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 CWC24YLR323C 780 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 AIM32YML050W 936 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SPC2YML055W 537 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 RPL11AYPR102C 525 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 IRA2YOL081W 9240 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 UTP5YDR398W 1932 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 VTC3YPL019C 2508 nt2.28□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 KRE33YNL132W 3171 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 HSE1YHL002W 1359 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 SLK19YOR195W 2466 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 SLF1YDR515W 1344 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 FAR11YNL127W 2862 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 SNA4YDL123W 423 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 CBS2YDR197W 1170 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YAL064WYAL064W 285 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 RPS29AYLR388W 171 nt2.27□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 CST9YLR394W 1449 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 FUS2YMR232W 2034 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YMR31YFR049W 372 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YFR057WYFR057W 456 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 ERG25YGR060W 930 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 RPS1AYLR441C 768 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 HAT1YPL001W 1125 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 SEC66YBR171W 621 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 SEC16YPL085W 6588 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 SRB4YER022W 2064 nt2.26□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 TOR1YJR066W 7413 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 APC2YLR127C 2562 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 RPN3YER021W 1572 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 ANR2YKL047W 1551 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 NSE4YDL105W 1209 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 RAV2YDR202C 1056 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 YDR262WYDR262W 819 nt2.25□□□□□ -2.05
RRP42Q12277 KEI1YDR367W 666 nt2.25□□□□□ -2.05
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