Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 TIF4631YGR162W 2859 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 IKS1YJL057C 2004 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YDR061WYDR061W 1620 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 AVT3YKL146W 2079 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 ARN2YHL047C 1863 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YHR182WYHR182W 2358 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-BRQ12217 YDR250CYDR250C 276 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 MTC3YGL226W 372 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 GRS1YBR121C 2004 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 STB2YMR053C 2553 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 MSC2YDR205W 2175 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YBR238CYBR238C 2196 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 KRI1YNL308C 1776 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 MRP10YDL045W-A 288 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 RPC10YHR143W-A 213 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 HTB2YBL002W 396 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 PFY1YOR122C 381 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 MRPS16YPL013C 366 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 SRS2YJL092W 3525 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 ECM25YJL201W 1800 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 BUD5YCR038C 1929 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 RIP1YEL024W 648 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YER188C-AYER188C-A 300 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 OM45YIL136W 1182 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 SHH3YMR118C 591 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YMR122CYMR122C 375 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 SUI1YNL244C 327 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 snR10snR10 245 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 ATG12YBR217W 561 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 IRC3YDR332W 2070 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 ARG2YJL071W 1725 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YKL222CYKL222C 2118 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 VPS41YDR080W 2979 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 CYK3YDL117W 2658 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 RAD53YPL153C 2466 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 VAC14YLR386W 2643 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 OPT2YPR194C 2634 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 CDC26YFR036W 375 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 HOR7YMR251W-A 180 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YML082WYML082W 1950 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 EMP70YLR083C 2004 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 SMI1YGR229C 1518 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 REV1YOR346W 2958 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 TPS3YMR261C 3165 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 MSH4YFL003C 2637 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 DAD4YDR320C-A 219 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YEL068CYEL068C 333 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 GCG1YER163C 699 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 BCD1YHR040W 1101 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 RPB11YOL005C 363 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 SWD3YBR175W 948 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YDR544CYDR544C 429 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 TRS85YDR108W 2097 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 RPS26BYER131W 360 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 RPL29YFR032C-A 180 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YLR053CYLR053C 327 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BRQ12217 YDR109CYDR109C 2148 nt4.84□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 KRS1YDR037W 1776 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 SYG1YIL047C 2709 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 NAN1YPL126W 2691 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 ARF1YDL192W 546 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 CYB5YNL111C 363 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 LRE1YCL051W 1752 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 MRK1YDL079C 1506 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 SDH4YDR178W 546 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 COX18YGR062C 951 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 LSM2YBL026W 288 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 EGD1YPL037C 474 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YBR259WYBR259W 2067 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 HUL4YJR036C 2679 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 PBS2YJL128C 2007 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YDL011CYDL011C 324 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 RPL14BYHL001W 417 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 ATG33YLR356W 594 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 BEM4YPL161C 1902 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 TDA1YMR291W 1761 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 PUT2YHR037W 1728 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 DAL81YIR023W 2913 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 SYF1YDR416W 2580 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 PRO3YER023W 861 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YKR033CYKR033C 426 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YPL025CYPL025C 558 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 LTP1YPR073C 486 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 SIN4YNL236W 2925 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 MDM32YOR147W 1869 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 DNM1YLL001W 2274 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 CUL3YGR003W 2235 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 MET12YPL023C 1974 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 PEX11YOL147C 711 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 TRM7YBR061C 933 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YRF1-4YLR466W 4149 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 MBP1YDL056W 2502 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 OAF1YAL051W 3144 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.78□□□□□ -1.64
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