Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 FUN30YAL019W 3396 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 UBX3YDL091C 1368 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 PRE1YER012W 597 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 FAR7YFR008W 666 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YGL159WYGL159W 1113 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YJR087WYJR087W 351 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YNL235CYNL235C 432 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 ATG3YNR007C 933 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 CSI2YOL007C 1026 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YAP7YOL028C 738 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YPL107WYPL107W 747 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 AFT2YPL202C 1251 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YBR300CYBR300C 498 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 TCB2YNL087W 3537 nt3.05□□□□□ -1.92
UBP11P36026 SHS1YDL225W 1656 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 PEA2YER149C 1263 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 TDA8YAL064C-A 381 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 SEC14YMR079W 915 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 BUD21YOR078W 645 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 NTC20YBR188C 423 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 SPO14YKR031C 5052 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 FLO1YAR050W 4614 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 RIF1YBR275C 5751 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YJL132WYJL132W 2253 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 MET5YJR137C 4329 nt3.04□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YSP2YDR326C 4317 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YKL100CYKL100C 1764 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 snR9snR9 187 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 RRT13YER066W 558 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 LRP1YHR081W 555 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 FRE2YKL220C 2136 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 RPL23AYBL087C 414 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 RPL20BYOR312C 519 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 YPL068CYPL068C 882 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 CCT7YJL111W 1653 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 PDC2YDR081C 2778 nt3.03□□□□□ -1.92
UBP11P36026 PSK1YAL017W 4071 nt3.03□□□□□ -1.93
UBP11P36026 ATP22YDR350C 2055 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 DNA2YHR164C 4569 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 snR5snR5 204 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YGR293CYGR293C 462 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 JIP3YLR331C 378 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 GMC2YLR445W 567 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YNL043CYNL043C 321 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 ERG11YHR007C 1593 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 CTF13YMR094W 1437 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 RIX1YHR197W 2292 nt3.02□□□□□ -1.93
UBP11P36026 RSN1YMR266W 2862 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 SNA4YDL123W 423 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YDR029WYDR029W 315 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 PRS3YHL011C 963 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 MCR1YKL150W 909 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 RLP24YLR009W 600 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 MPP6YNR024W 561 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 VHR2YER064C 1518 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 SRC1YML034W 2505 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 AYT1YLL063C 1425 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 BUB1YGR188C 3066 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 NEL1YHR035W 1893 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 NDT80YHR124W 1884 nt3.01□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YPL150WYPL150W 2706 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 JJJ2YJL162C 1752 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YHR213WYHR213W 597 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YJL086CYJL086C 369 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YJR141WYJR141W 1044 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 CDC123YLR215C 1083 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YAR062WYAR062W 597 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 ATP18YML081C-A 180 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 NMA111YNL123W 2994 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 MEI5YPL121C 669 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YBR071WYBR071W 636 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YNL193WYNL193W 1677 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 SWC4YGR002C 1431 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 GYP7YDL234C 2241 nt3□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YCL019WYCL019W 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 SRB4YER022W 2064 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 CRD1YDL142C 852 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 TDA2YER071C 381 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 STE18YJR086W 333 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 DAD2YKR083C 402 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YMR254CYMR254C 309 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 NGL1YOL042W 1092 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YBR051WYBR051W 351 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 YDR338CYDR338C 2088 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 ITC1YGL133W 3795 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 SIN3YOL004W 4611 nt2.99□□□□□ -1.93
UBP11P36026 ATG13YPR185W 2217 nt2.99□□□□□ -1.93
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