Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTHFD1P11586 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTHFD1P11586 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms