Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPT2A6NK58 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPT2A6NK58 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPT2A6NK58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPT2A6NK58 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms