Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASS4Q9NQ75 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms