Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP13Q86W25 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms