Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 YLR278CYLR278C 4026 nt2.84□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 NMA111YNL123W 2994 nt2.84□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 TFC4YGR047C 3078 nt2.84□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 FUN30YAL019W 3396 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 CAF120YNL278W 3183 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YDR042CYDR042C 603 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YHR054CYHR054C 1065 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 DYN3YMR299C 939 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YPL107WYPL107W 747 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 AFT2YPL202C 1251 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 KAR4YCL055W 1008 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 BNA4YBL098W 1383 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ADY4YLR227C 1482 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 NGG1YDR176W 2109 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 URK1YNR012W 1506 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ANR2YKL047W 1551 nt2.83□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 TRM2YKR056W 1920 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YDR203WYDR203W 318 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ERG28YER044C 447 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YGR018CYGR018C 330 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YGR115CYGR115C 780 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YLR297WYLR297W 390 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 RPC40YPR110C 1008 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ARL1YBR164C 552 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 SLF1YDR515W 1344 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 NOP12YOL041C 1380 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 VAC8YEL013W 1737 nt2.82□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 SKT5YBL061C 2091 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 MOT1YPL082C 5604 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 SUL1YBR294W 2580 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 AST2YER101C 1293 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YLR050CYLR050C 486 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 MRPL33YMR286W 261 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 POP7YBR167C 423 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ESC2YDR363W 1371 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 NUR1YDL089W 1455 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ERG11YHR007C 1593 nt2.81□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YPL216WYPL216W 3309 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 PBS2YJL128C 2007 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 CEP3YMR168C 1827 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 CST9YLR394W 1449 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 SRD1YCR018C 666 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 RMD6YEL072W 696 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YGL109WYGL109W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YKL123WYKL123W 381 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 PEX27YOR193W 1131 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 RPS12YOR369C 432 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ESL1YIL151C 3357 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ORC1YML065W 2745 nt2.8□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 RAD18YCR066W 1464 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 AGE1YDR524C 1449 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ERP6YGL002W 651 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 GOS1YHL031C 672 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YNR025CYNR025C 360 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 COQ10YOL008W 624 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YOR152CYOR152C 771 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 snR24snR24 89 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ASI3YNL008C 2031 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 IKI3YLR384C 4050 nt2.79□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 BPT1YLL015W 4680 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ISW1YBR245C 3390 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 SRB4YER022W 2064 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 FUS2YMR232W 2034 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 APC2YLR127C 2562 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 RLI1YDR091C 1827 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 CDC20YGL116W 1833 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 UBC13YDR092W 462 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 MVB12YGR206W 306 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 NOP19YGR251W 591 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 AIM18YHR198C 966 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ATG27YJL178C 816 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YPT52YKR014C 705 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YAR069CYAR069C 294 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 CWC24YLR323C 780 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 PRE8YML092C 753 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 YOR331CYOR331C 558 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 ICR1ICR1 3199 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 SRP1YNL189W 1629 nt2.78□□□□□ -1.96
SMF3Q12078 CDC37YDR168W 1521 nt2.78□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 GCD10YNL062C 1437 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 TOP2YNL088W 4287 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 SLP1YOR154W 1764 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 VAB2YEL005C 849 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 PNC1YGL037C 651 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 YHR213WYHR213W 597 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 CAP1YKL007W 807 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 ATG10YLL042C 504 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 YAR062WYAR062W 597 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 RPL16BYNL069C 597 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 BRX1YOL077C 876 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 YBR063CYBR063C 1215 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 snR191snR191 274 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 DYN1YKR054C 12279 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 TOM1YDR457W 9807 nt2.77□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 MAL33YBR297W 1407 nt2.76□□□□□ -1.97
SMF3Q12078 ARP5YNL059C 2268 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90.3 ms