Protein–RNA interactions for Protein: P61129

ZC3H6, Zinc finger CCCH domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H6P61129 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H6P61129 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H6P61129 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms