Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPB1P53618 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB1P53618 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB1P53618 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB1P53618 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB1P53618 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB1P53618 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms