Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms