Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms