Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARID3CA6NKF2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms