Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms