Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRKQ15262 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
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