Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID2Q14112 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID2Q14112 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NID2Q14112 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NID2Q14112 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NID2Q14112 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NID2Q14112 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NID2Q14112 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID2Q14112 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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