Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APJ1P53940 YLR297WYLR297W 390 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 YML003WYML003W 873 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 YNL035CYNL035C 1170 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 CAT5YOR125C 702 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 JIP5YPR169W 1479 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 FUN30YAL019W 3396 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 ARG2YJL071W 1725 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 CDC20YGL116W 1833 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 SST2YLR452C 2097 nt2.56□□□□□ -2
APJ1P53940 CDC37YDR168W 1521 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 CGR1YGL029W 363 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 CTM1YHR109W 1758 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 YHR213WYHR213W 597 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 YAR062WYAR062W 597 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 TRM12YML005W 1389 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 IGO1YNL157W 507 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 HUB1YNR032C-A 222 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 FYV12YOR183W 390 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 RPB5YBR154C 648 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 BPT1YLL015W 4680 nt2.55□□□□□ -2
APJ1P53940 DSE1YER124C 1722 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 PLM2YDR501W 1566 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 MOT1YPL082C 5604 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 YDR114CYDR114C 303 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 VPS74YDR372C 1038 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 RMT2YDR465C 1239 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 AGA2YGL032C 264 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 SDP1YIL113W 630 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 ATG27YJL178C 816 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 ILM1YJR118C 612 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 RNP1YLL046C 750 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 RNH203YLR154C 333 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 COA4YLR218C 453 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 YNL109WYNL109W 546 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 YNL146WYNL146W 303 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 TSR4YOL022C 1227 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 LEE1YPL054W 906 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 POL30YBR088C 777 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 ATP25YMR098C 1839 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 SRB8YCR081W 4284 nt2.54□□□□□ -2
APJ1P53940 CST9YLR394W 1449 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 RRT13YER066W 558 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 THG1YGR024C 714 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YJR128WYJR128W 360 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YLR230WYLR230W 306 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YLR400WYLR400W 474 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YMR254CYMR254C 309 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 ATX2YOR079C 942 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 CAF20YOR276W 486 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 YOR387CYOR387C 621 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 RFC5YBR087W 1065 nt2.53□□□□□ -2
APJ1P53940 TSC11YER093C 4293 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YDL050CYDL050C 372 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 DAD1YDR016C 285 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 BMH2YDR099W 822 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YDR340WYDR340W 303 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 PEA2YER149C 1263 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 MDV1YJL112W 2145 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 MBB1YJL199C 327 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 FRE2YKL220C 2136 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YBR012CYBR012C 420 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 MIP6YHR015W 1980 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 ASM4YDL088C 1587 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 CBP2YHL038C 1893 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 SIN4YNL236W 2925 nt2.52□□□□□ -2.01
APJ1P53940 PBS2YJL128C 2007 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 VAS1YGR094W 3315 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 SLF1YDR515W 1344 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YCL020WYCL020W 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 RSN1YMR266W 2862 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 VMA8YEL051W 771 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YHL005CYHL005C 393 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YAP5YIR018W 738 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 EAF6YJR082C 342 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YOR029WYOR029W 336 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 RBL2YOR265W 321 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 MSM1YGR171C 1728 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 ARP9YMR033W 1404 nt2.51□□□□□ -2.01
APJ1P53940 NTO1YPR031W 2247 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 NDC80YIL144W 2076 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 MRH1YDR033W 963 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 ECM11YDR446W 909 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 LOC1YFR001W 615 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 MRPL9YGR220C 810 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.5□□□□□ -2.01
APJ1P53940 YAR075WYAR075W 474 nt2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms