Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 VHR1YIL056W 1923 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 TFC4YGR047C 3078 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RIM1YCR028C-A 408 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RRT13YER066W 558 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 GEP7YGL057C 864 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 GPX1YKL026C 504 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SMD3YLR147C 306 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YSF3YNL138W-A 258 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YOL106WYOL106W 354 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 AFT2YPL202C 1251 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ASI3YNL008C 2031 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YGL176CYGL176C 1665 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SRB4YER022W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC28P40509 BRE5YNR051C 1548 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SIN3YOL004W 4611 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 GEA1YJR031C 4227 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 RPL23BYER117W 414 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YLR012CYLR012C 300 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YLR365WYLR365W 333 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 RPB8YOR224C 441 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YOR385WYOR385W 873 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 CEP3YMR168C 1827 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 FIR1YER032W 2631 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 NGG1YDR176W 2109 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 RIM13YMR154C 2184 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ESL2YKR096W 3588 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 BCK1YJL095W 4437 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 HTB1YDR224C 396 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ERG28YER044C 447 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 HMF1YER057C 390 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 AST2YER101C 1293 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 RPL16BYNL069C 597 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 PRP8YHR165C 7242 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR193WYDR193W 399 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SLD5YDR489W 885 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ATG27YJL178C 816 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 APC9YLR102C 798 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 PET20YPL159C 762 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 NTC20YBR188C 423 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 NSA1YGL111W 1392 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 AGE1YDR524C 1449 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 MAL33YBR297W 1407 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SLP1YOR154W 1764 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SLH1YGR271W 5904 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 FUS2YMR232W 2034 nt2.81□□□□□ -1.96
SEC28P40509 DBP7YKR024C 2229 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SLF1YDR515W 1344 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR209CYDR209C 414 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 KEI1YDR367W 666 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ERP6YGL002W 651 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.8□□□□□ -1.96
SEC28P40509 FLO11YIR019C 4104 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YER138CYER138C 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YER160CYER160C 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YJR027WYJR027W 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YML039WYML039W 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YML045WYML045W 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YMR050CYMR050C 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 BNA4YBL098W 1383 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 PIB1YDR313C 861 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 VMA7YGR020C 357 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 MTM1YGR257C 1101 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 COX6YHR051W 447 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YIL012WYIL012W 342 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YLR050CYLR050C 486 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YLR198CYLR198C 360 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 YLR257WYLR257W 966 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 HUA2YOR284W 732 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 snR24snR24 89 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ARL1YBR164C 552 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 TRM2YKR056W 1920 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SLK19YOR195W 2466 nt2.79□□□□□ -1.96
SEC28P40509 SUL1YBR294W 2580 nt2.78□□□□□ -1.96
SEC28P40509 UTP5YDR398W 1932 nt2.78□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ATX1YNL259C 222 nt2.78□□□□□ -1.96
SEC28P40509 snR191snR191 274 nt2.78□□□□□ -1.96
SEC28P40509 GCV2YMR189W 3105 nt2.78□□□□□ -1.96
SEC28P40509 ANR2YKL047W 1551 nt2.78□□□□□ -1.96
SEC28P40509 RTG3YBL103C 1461 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 ECM29YHL030W 5607 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RTT10YPL183C 3042 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 TOM1YDR457W 9807 nt2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 180.1 ms