Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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