Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 YJR020WYJR020W 333 nt2.84□□□□□ -1.95
AEP3Q12089 GIM5YML094W 492 nt2.84□□□□□ -1.95
AEP3Q12089 INP1YMR204C 1263 nt2.84□□□□□ -1.95
AEP3Q12089 MRPL40YPL173W 894 nt2.84□□□□□ -1.95
AEP3Q12089 YNL193WYNL193W 1677 nt2.84□□□□□ -1.95
AEP3Q12089 PCI8YIL071C 1335 nt2.84□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YLR278CYLR278C 4026 nt2.84□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YCL019WYCL019W 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 JSN1YJR091C 3276 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SLK19YOR195W 2466 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YCK2YNL154C 1641 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 COP1YDL145C 3606 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 DOG2YHR043C 741 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 REC102YLR329W 795 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 NTC20YBR188C 423 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YBR287WYBR287W 1284 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 NSA1YGL111W 1392 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ITC1YGL133W 3795 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RAD18YCR066W 1464 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 CDC37YDR168W 1521 nt2.83□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 UBP14YBR058C 2346 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 FUN30YAL019W 3396 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 REC8YPR007C 2043 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 snR83snR83 306 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SPO11YHL022C 1197 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RPL20AYMR242C 519 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 HUT1YPL244C 1020 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YPR203WYPR203W 309 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 MED8YBR193C 672 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SHG1YBR258C 429 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RIM13YMR154C 2184 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 VPS30YPL120W 1674 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 CIN8YEL061C 3003 nt2.82□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 BOI1YBL085W 2943 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 NET1YJL076W 3570 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YDR262WYDR262W 819 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 MTC3YGL226W 372 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 CSI2YOL007C 1026 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 BRX1YOL077C 876 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ATP20YPR020W 348 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 URK1YNR012W 1506 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 DBP7YKR024C 2229 nt2.81□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RIM1YCR028C-A 408 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 LOC1YFR001W 615 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RPL11BYGR085C 525 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 CPR7YJR032W 1182 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 GOT1YMR292W 417 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RPL16BYNL069C 597 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 NGL1YOL042W 1092 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RRG7YOR305W 729 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RPL11AYPR102C 525 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 TFB1YDR311W 1929 nt2.8□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 STE23YLR389C 3084 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 JJJ2YJL162C 1752 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 DBF20YPR111W 1695 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RGR1YLR071C 3249 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 BNA4YBL098W 1383 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 DNM1YLL001W 2274 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SAE2YGL175C 1038 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 TCD1YHR003C 1290 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ATG27YJL178C 816 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RPL22AYLR061W 366 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 LIP2YLR239C 987 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YAR069CYAR069C 294 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YPL107WYPL107W 747 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 POP7YBR167C 423 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ASI3YNL008C 2031 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ARK1YNL020C 1917 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 VPS53YJL029C 2469 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 BIT61YJL058C 1632 nt2.79□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ATG13YPR185W 2217 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 ADY4YLR227C 1482 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SEN54YPL083C 1404 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 MET10YFR030W 3108 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 INP52YNL106C 3552 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 SNA4YDL123W 423 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 RSM28YDR494W 1086 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 TAD1YGL243W 1203 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YGR017WYGR017W 894 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 YGR115CYGR115C 780 nt2.78□□□□□ -1.96
AEP3Q12089 PCL5YHR071W 690 nt2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.1 ms