Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 TFC4YGR047C 3078 nt2.96□□□□□ -1.93
CIK1Q01649 YOL057WYOL057W 2136 nt2.96□□□□□ -1.93
CIK1Q01649 YDR090CYDR090C 933 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YFR057WYFR057W 456 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 MTC3YGL226W 372 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ATG10YLL042C 504 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 LIP2YLR239C 987 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RPL23AYBL087C 414 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 DCP1YOL149W 696 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YOR097CYOR097C 528 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 HAT1YPL001W 1125 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 PET20YPL159C 762 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 JJJ1YNL227C 1773 nt2.96□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 BPT1YLL015W 4680 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ERG25YGR060W 930 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RSR1YGR152C 819 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 COX23YHR116W 456 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 CPR7YJR032W 1182 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SFT1YKL006C-A 294 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ECM4YKR076W 1113 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 MRPL40YPL173W 894 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 PMR1YGL167C 2853 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 HSE1YHL002W 1359 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SOK1YDR006C 2706 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 NUR1YDL089W 1455 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 TFB1YDR311W 1929 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 UTP5YDR398W 1932 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 NGG1YDR176W 2109 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 GCD6YDR211W 2139 nt2.95□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ECM29YHL030W 5607 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 CST9YLR394W 1449 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YDR193WYDR193W 399 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SAE2YGL175C 1038 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YLR050CYLR050C 486 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RPL22AYLR061W 366 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 PEX27YOR193W 1131 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 DNM1YLL001W 2274 nt2.94□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 BRE5YNR051C 1548 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 BIT61YJL058C 1632 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SRB8YCR081W 4284 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RSM27YGR215W 333 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SDO1YLR022C 753 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 NGL1YOL042W 1092 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RAX2YLR084C 3663 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 CDC20YGL116W 1833 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 AI2Q0055 2565 nt2.93□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ERG11YHR007C 1593 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ERT1YBR239C 1590 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RPA190YOR341W 4995 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ARK1YNL020C 1917 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YCR100CYCR100C 951 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YGR017WYGR017W 894 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 IKI1YHR187W 930 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YAL066WYAL066W 309 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ILV5YLR355C 1188 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YMR181CYMR181C 465 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YPL107WYPL107W 747 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 DIM1YPL266W 957 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 KIN82YCR091W 2163 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 JJJ2YJL162C 1752 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 FRE2YKL220C 2136 nt2.92□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YER138CYER138C 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YER160CYER160C 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YJR027WYJR027W 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YML039WYML039W 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YML045WYML045W 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YMR050CYMR050C 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 CDC55YGL190C 1581 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 CEP3YMR168C 1827 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SAG1YJR004C 1953 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 TIM11YDR322C-A 291 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SLD5YDR489W 885 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 HPA3YEL066W 540 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YGL230CYGL230C 444 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 AIM36YMR157C 768 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 YSF3YNL138W-A 258 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 ATP11YNL315C 957 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 HSP10YOR020C 321 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 SFG1YOR315W 1041 nt2.91□□□□□ -1.94
CIK1Q01649 RRG8YPR116W 834 nt2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms