Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP1P59025 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP1P59025 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP1P59025 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP1P59025 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP1P59025 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP1P59025 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP1P59025 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms