Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ARP8YOR141C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RIM13YMR154C 2184 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SPF1YEL031W 3648 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RPL23BYER117W 414 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 MST28YAR033W 705 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 PML39YML107C 1005 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 CTL1YMR180C 963 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YMR187CYMR187C 1296 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 HSP10YOR020C 321 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 CAT5YOR125C 702 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 CSH1YBR161W 1131 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YNL193WYNL193W 1677 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 DBF20YPR111W 1695 nt2.43□□□□□ -2.02
DDI1P40087 UTP15YMR093W 1542 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YOL057WYOL057W 2136 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 EMI1YDR512C 564 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YLR012CYLR012C 300 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 APC9YLR102C 798 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YLR339CYLR339C 552 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RIM9YMR063W 720 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RRD2YPL152W 1077 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 MDM36YPR083W 1740 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SEN54YPL083C 1404 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YEF3YLR249W 3135 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YMR046CYMR046C 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
DDI1P40087 TMA64YDR117C 1698 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 VHR1YIL056W 1923 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RSR1YGR152C 819 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YHR212CYHR212C 336 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 MBB1YJL199C 327 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SDO1YLR022C 753 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YAR060CYAR060C 336 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 MRPL33YMR286W 261 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 CCL1YPR025C 1182 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SIN3YOL004W 4611 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 UTP6YDR449C 1323 nt2.41□□□□□ -2.02
DDI1P40087 BI3Q0115 1554 nt2.4□□□□□ -2.02
DDI1P40087 CPR5YDR304C 678 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 TIM11YDR322C-A 291 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 HMF1YER057C 390 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 VMA10YHR039C-A 345 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SFT1YKL006C-A 294 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 CCE1YKL011C 1062 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YKR070WYKR070W 1059 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YML037CYML037C 1023 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SRT1YMR101C 1032 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 IRC13YOR235W 315 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 DUG2YBR281C 2637 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 TRM82YDR165W 1335 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YLR446WYLR446W 1302 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YPL150WYPL150W 2706 nt2.4□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SAK1YER129W 3429 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 PSD2YGR170W 3417 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YER138CYER138C 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YER160CYER160C 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YJR027WYJR027W 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YML039WYML039W 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YML045WYML045W 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YMR050CYMR050C 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YPK1YKL126W 2043 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 NOP56YLR197W 1515 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 LSM4YER112W 564 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 VEL1YGL258W 621 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YHL044WYHL044W 708 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RPL8BYLL045C 771 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YBL055CYBL055C 1257 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RPN8YOR261C 1017 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 JID1YPR061C 906 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RRG8YPR116W 834 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 FIR1YER032W 2631 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 HOP1YIL072W 1818 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 MDM10YAL010C 1482 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 JIP5YPR169W 1479 nt2.39□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YHR078WYHR078W 1659 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YPD1YDL235C 504 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RSM24YDR175C 960 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 MEI4YER044C-A 1227 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SEC4YFL005W 648 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 PDR1YGL013C 3207 nt2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms