Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE2O96020 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms