Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QLW9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QLW9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QLW9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QLW9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QLW9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QLW9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QLW9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QLW9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QLW9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QLW9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QLW9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QLW9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QLW9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QLW9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QLW9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms