Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms