Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms