Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INPP4AQ96PE3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INPP4AQ96PE3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms